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如果短信通知中只提到扣了三分，而没有明确提及罚款，那么通常不需要缴纳罚款。然而，为了确保自己的权益和准确性，建议采取以下步骤。
1、查看交通违法处理通知：除了短信通知外，通常还会收到正式的交通违法处理通知单，上面会详细列出所有的违法行为和相应的罚款金额。
2、登录交通管理部门网站查询：可以登录当地交通管理部门的网站，输入车辆信息和车牌号码，查看是否有其他未处理的交通违法记录及相应的罚款信息。
3、咨询当地交通管理部门：如果对短信通知的内容有任何疑问，可以直接联系当地的交通管理部门或交警队，咨询关于该通知的详细信息。
如果短信中只提到扣分而没有提到罚款，那么通常不需要缴纳罚款，为了确保自己的权益，最好通过正式渠道核实信息并查询相关记录。